Artemis Fowl II es un niño de 12 años con una mente brillante, descendiente de un largo linaje de criminales.
En un mundo donde la avaricia ha obligado a vivir bajo tierra a las hadas para escapar de la destructiva raza humana, el joven Artemis Fowl tendrá que prepararse para emprender una importante búsqueda.
Con la ayuda de su guardaespaldas Butler, descubrirá que una raza de hadas podría estar conectada con la desaparición de su padre.
Su aventura le llevará a conocer al hada Holly Short, a la que tomará como rehén para conseguir hacer un intercambio para traer de vuelta a su padre y restaurar así la fortuna familiar.