36 años después, es decir, en 1622, los jesuitas erigen la Universidad de Santo Tomás de Aquino en la que a los exclusivos estudios existentes: Filosofía, Teología, Medicina y Derecho, se incorporan estudios de retórica, álgebra, geometría y otros. En 1822, con la Batalla del Pichincha, culmina el proceso de independencia y en 1830 se constituye la República del Ecuador. El libertador, Bolívar, en el Congreso de Cundinamarca instituye la Universidad Central del Departamento de Ecuador el año de 1826, esta universidad que viene a ser algo así como la continuación de la de Santo Tomás dentro de los nuevos contextos académicos y políticos, por una época lleva el nombre de Universidad de Quito. El año de 1853 el General José María Urbina, hombre de tendencia liberal y anticlerical, proclama la libertad de enseñanza, en la que el apoyo oficial financiero sólo se extiende a la instrucción primaria, dejando al espíritu de empresa el establecimiento de nuevos colegios y al interés particular la obtención de las ciencias profesionales. En 1868, Jerónimo Carrión, quien sucede transitoriamente a Gabriel García Moreno, funda la Universidad de Cuenca y la de Guayaquil, contra la voluntad del segundo de los nombrados. De retorno al gobierno, García Moreno en 1869, clausura la Universidad de Quito e interviene las universidades de Cuenca y Guayaquil y, mediante la convención nacional de ese mismo año, crea la Escuela Politécnica Nacional, Derecho y Medicina pasan a ser tratados en los colegios y la teología queda suprimida como carrera universitaria del Estado. En 1875, tras la muerte de García Moreno,el presidente Antonio Borrero clausura la Politécnica y reabre la Universidad de Quito, restaurándole su estructura y derechos. En 1925 acontece la Revolución juliana. Se dictó una ley de Educación Superior en la que se consagró por primera vez el principio de la autonomía universitaria. Llegamos al año 1952 y el 29 de octubre de ese mismo año, mediante decreto legislativo, se creó la Universidad Técnica de Manabí. El Presidente de la República, Dr, José María Velasco Ibarra puso el ejecútese correspondiente el 21 de noviembre del año indicado. Mediante oficio de 8 de abril de 1954. El Dr. José Martínez Cobo, entonces Ministro de Educación, comunica al Ing. Paulo Emilio Macías Sabando que el sr. Presidente de la República, mediante acuerdo N º 407 de esa fecha lo ha nombrado Rector de la Universidad Técnica de Manabí, con el sueldo mensual de tres mil sucres. La UTM comienza a funcionar de 25 de junio de 1954, por lo que hoy 25 de junio del 2007 cumple 53 años de funcionamiento brindando el servicio de la educación a los jóvenes. .