Manabí es considerada la región 4, que abarca a la provincia de Santo Domingo de los Tsáchilas y de aquí se explica que varias entidades que funcionan en Portoviejo hayan abierto oficinas en Ciudad Alfaro. Esta situación en los últimos días ha generado polémicas en esta localidad porque se critica que ahora las personas tengan que viajar hasta Montecristi para encontrar a los funcionarios de algunos Ministerios. También porque se asegura que disminuirá el movimiento comercial. Ante estas aseveraciones el gobernador de la provincia, Vicente Véliz, en días pasados explicó a la Corporación Municipal de Portoviejo que Ciudad Alfaro se convertirá en un planificador de Manabí y la región, y que la ciudad no perderá las entidades gubernamentales. Además dijo que los funcionarios están en la obligación de atender en ambas partes. Hasta ahora Ciudad Alfaro es la única sede en el país que ha entrado a funcionar parcialmente y según la Semplades deberá estar totalmente implementada en un año. Opinión Félix Alcívar potencial candidato a ocupar la alcaldía de Portoviejo, manifestó que una de sus propuestas ha sido jerarquizar al cantón como capital de la provincia y que no está de acuerdo en que se le quiten sus competencias a pesar del proceso de regionalización que se está implementando. En todo caso de llegar a la alcaldía aseguró que luchará para que Portoviejo siga siendo el centro político de Manabí.