Los actores llegaron a un acuerdo respecto la custodia de la hija que tienen en común. En el documento se estipulan restricciones relativas al contacto de la niña con la iglesia de la Cienciología, de la que Cruise es miembro. Habrían sido precisamente los estrechos vínculos del actor con esta iglesia los que según fuentes cercanas a la pareja, motivaron la decisión de Katie Holmes de poner fin a su matrimonio. <