Benedicto XVI, en el último día de su peregrinación, mantuvo un encuentro ecuménico en el Patriarcado Greco-Ortodoxo de Jerusalén, donde se reunió con Teófilo III y dijo que a la hora de presentar el mensaje de reconciliación de Cristo, los cristianos "experimentamos la vergüenza de nuestra división". "Tenemos que encontrar la fuerza de redoblar nuestro compromiso para perfeccionar nuestra comunión, para hacerla completa", afirmó el Obispo de Roma. El Papa Ratzinger recordó el abrazo, aquí, en Jerusalén, entre el papa Pablo VI y el patriarca de Constantinopla y jefe de la Iglesia Ortodoxa griega, Atenágoras, en 1964, y el de Juan Pablo II y el patriarca Diodoros I en el año 2000, durante la visita del Papa Wojtyla a los Santos Lugares. El Obispo de Roma afirmó que estando al lado del Santo Sepulcro "quién no se siente empujado" a potenciar el compromiso ecuménico y abogó para este encuentro de impulso a los trabajos de la Comisión Internacional Conjunta para el diálogo Teológico entre la Iglesia Católica y la Ortodoxa. Tras este encuentro, el Papa se trasladó al Santo Sepulcro. El Papa siempre ha dicho que la separación de los cristianos es una ofensa a Dios y un pecado.