En Ciudad Alfaro funciona la oficina técnica de la Subsecretaría de Gestión Marino Costera del Ministerio del Ambiente que tiene a su cargo Montecristi, Jaramijó, Manta y Portoviejo.
Allì se coordinan proyectos para la costa central manabita como apoyo al relleno sanitario para Crucita de Portoviejo, la estabilización del cerro Peñón del Diablo en Jaramijó, la zonificación y certificación de playas, censos pesqueros y planes de manejo para áreas protegidas como el bosque de Pacoche de Manta.
La subsecretaría prevé invertir unos 744.900 dólares durante este año y unos 506.000 dólares para el 2010 en toda la provincia.