Arellano fue acusado por los empleados de la Superintendencia de haber ordenado el retiro "voluntario" de un porcentaje de sus salarios que iban a una cuenta, no registrada en el TSE, del movimiento oficialistaAlianza País. El TSE aplicó la Ley de Partidos que prohíbe a todo funcionario público pedir aportaciones económicas con fines políticos. Cuando surgió la denuncia, el Presidente de la República le expresó públicamente su respaldo.